Información de la convocatoria
Este Curso está acreditado por la Dirección Provincial de Educación y es puntuable para oposiciones y como mérito de formación permanente.
MODALIDAD
Presencial
OBJETIVOS
-. Introducir los fundamentos de la bioinformática aplicada a la microbiología, con énfasis en el análisis genómico y metagenómico.
-. Distinguir entre las principales tecnologías de secuenciación de alto rendimiento, especialmente Illumina y Oxford Nanopore (MinION), reconociendo sus ventajas, limitaciones y aplicaciones en microbiología.
-. Capacitar al alumnado en el uso de entornos Linux (WSL) y herramientas bioinformáticas estándar.
-. Utilizar la inteligencia artificial (IA), para apoyar procesos analíticos: redacción de scripts, depuración de errores, interpretación de resultados y automatización de tareas.
-. Aplicar herramientas de anotación funcional, como InterProScan, para caracterizar proteínas codificadas por genomas virales o bacterianos.
-. Aplicar metodologías de ensamblaje de genomas o metagenomas, así como procesos de filtrado de secuencias.
-. Utilizar herramientas bioinformáticas para la identificación taxonómica de genomas bacterianos o virales.
-. Identificar genes de resistencia antimicrobiana, factores de virulencia y elementos móviles como plásmidos mediante herramientas especializadas.
PROGRAMA
El curso se desarrollará en cinco jornadas intensivas (4 horas por día), combinando teoría aplicada con ejercicios prácticos.
Contenidos principales:
.- Día 1: Introducción a los fundamentos del análisis bioinformático. Comparación entre tecnologías de secuenciación (Illumina vs. Oxford Nanopore – MinION): diferencias clave, ventajas, limitaciones y formatos generados. Instalación del entorno Linux mediante WSL y configuración de VSCode. Comandos esenciales de Linux y organización del entorno de trabajo bioinformático. Descarga de muestras reales desde el NCBI: asignación individual de un tipo de muestra por participante (metagenomas ambientales o genomas completos) para ser trabajadas durante el curso.
.- Día 2: Genómica bacteriana –montaje de genomas con SPAdes, anotación con Prokka y detección de genes de resistencia y virulencia mediante Abricate con bases como CARD, ResFinder, PlasmidFinder y VFDB. Identificación taxonómica mediante BLASTn o Kraken2.
.- Día 3: Metagenómica – ensamblaje de muestras complejas con metaSPAdes, clasificación taxonómica y análisis exploratorio de comunidades microbianas.
.- Día 4: Viromas y moviloma – detección de fagos y virus en genomas o metagenomas utilizando VIBRANT yVirSorter2, análisis de fagos lisogénicos/líticos y correlación con genes antimicrobianos.
.- Día 5: Análisis funcional e integración – uso de InterProScan para caracterizar proteínas codificadas por genomas bacterianos o virales. Aplicación de inteligencia artificial como apoyo en la interpretación funcional, automatización de pasos del pipeline, depuración de errores y redacción de informes técnicos
SISTEMAS Y PROCEDIMIENTO DE EVALUACIÓN
La evaluación será continua, práctica y orientada a la resolución de preguntas reales.
Desde el inicio del curso, cada participante deberá plantear uno o más interrogantes que desee responder utilizando herramientas bioinformáticas. Estos objetivos personales guiarán su trabajo durante las sesiones prácticas. Al final de cada jornada, se evaluará si el/la alumno/a ha sido capaz de aplicar correctamente los programas trabajados (SPAdes, Prokka, Abricate, VIBRANT, InterProScan, entre otros) para avanzar en el análisis de su genoma o metagenoma. Como cierre, el día 5 estará parcialmente dedicado a la
presentación oral de los resultados individuales o en grupo, con una duración de hasta 20 minutos por proyecto, seguida de discusión conjunta. La evaluación final tendrá en cuenta:
.- La capacidad de ejecutar correctamente los análisis bioinformáticos enseñados
.- La pertinencia de las preguntas planteadas y el grado en que fueron abordadas
.- La claridad y profundidad en la interpretación de resultados
.- El uso autónomo de herramientas y recursos, incluyendo inteligencia artificial como apoyo
.- La participación activa en las sesiones y en las presentaciones de los compañeros
BREVE EXPLICACIÓN
Este curso intensivo está dirigido a personas interesadas en iniciarse en el uso práctico de la bioinformática en contextos microbiológicos, sin necesidad de experiencia previa en programación, Linux o análisis de datos. A lo largo del curso, los participantes aprenderán desde cero a utilizar herramientas ampliamente empleadas en estudios genómicos y metagenómicos, como SPAdes, Prokka, Abricate, Kraken y VIBRANT, entre otras. El contenido se presentará de forma accesible, combinando teoría y práctica con ejercicios guiados paso a paso. No se requiere un ordenador potente: basta con un portátil con aproximadamente 10 GB de espacio libre. Las actividades se realizarán en un servidor remoto ya configurado, eliminando la necesidad de instalar programas localmente.
LUGAR
Clases presenciales: Universidad de Burgos – Facultad de Ciencias. Aula 18
Parte online: Plataforma UBUVirtual de la Universidad de Burgos
PROFESORADO
Director y ponente: Rafael Cadamuro Dorighello (UBU)
E-mail: rdorighello@ubu.es cadamuro.rafael@gmail.com
CALENDARIO
Del 22 al 29 de septiembre de 2025 (El día 26 es fiesta)
HORARIO
De 16:00 a 20:00
DURACIÓN
20 horas.
PRECIO
- Matrícula ordinaria: 65 €. Personas interesadas.
- Matrícula reducida: 55 €. Miembros de la comunidad universitaria de la UBU.
CRÉDITOS
Solicitados créditos para Grados.
